Если во время установки не был выбран параметр Web Server Rewrites, то это возможно и необходимо сделать после. Причина в том, что для поисковой оптимизации более приемлем адрес строки содержащий строго необходимую информацию, а «index.php» таковой не является.
В Magento эта оптимизация достигается путем использования параметра Web Server Rewrites. Для его использования в Apache должен быть включен модуль mod_rewrite.
Чтоб убрать из адресной строки index.php необходимо перейти во вкладку Система, выбрать пункт выпадающего меню Конфигурация, далее в левом меню в разделе Общие перейти в пункт Интернет и там вы увидите раздел Поисковая оптимизация (SEO). Где нужно переключить Использовать Web Server Rewrites на Да.
Порядок перехода таков:
Система > Конфигурация > Интернет > Поисковая оптимизация (SEO)
В случае, когда вы только приступили к установке Magento, включить использование параметра возможно на этапе Конфигурация в Парамтеры веб-доступа поставив галочку.
